1、应用不同
数字货币：快捷、经济和安全的支付结算；票据金融和供应链金融；抵押品物权数字化。
电子货币：卖方将买方的支付指令通过支付网关送往卖方的收单行；收单行通过银行卡网络从发卡行获得授权许可，并将授权信息再通过支付网关送回卖方；卖方取得授权后，向买方发出购物完成信息。如果支付获取与支付授权不能同时完成，卖方还要通过支付网关向收单行发送支付获取请求，把该笔交易的资金由买方转账到卖方的账户中。银行与银行之间通过支付系统完成最后的行间结算。
2、特点不同
数字货币特点是交易成本低、交易速度快、高度匿名性。
电子货币特点是匿名性、节省交易费用、节省传输费用、持有风险小、支付灵活方便、防伪造及防重复性、不可跟踪性。
3、种类不同
数字货币分为三类：完全封闭的、与实体经济毫无关系且只能在特定虚拟社区内使用，如魔兽世界黄金；可以用真实货币购买但不能兑换回真实货币，可用于购买虚拟商品和服务，如Facebook信贷；可以按照一定的比率与真实货币进行兑换、赎回，既可以购买虚拟的商品服务，也可以购买真实的商品服务，如比特币。
电子货币：基于互联网环境使用的且将代表货币价值的二进制数据保管在微机终端硬盘内的电子现金；将货币价值保存在IC卡内并可脱离银行支付系统流通的电子钱包。
