1、结构不同。翡翠和玛瑙都属于高档的玉石品种，但两者的结构成分却是不同的，翡翠是纤维交织结构，通过放大镜观察，大都会看到组成矿物的颗粒，而玛瑙隐晶质集合体，结构致密，一般看不到结晶体的颗粒。
2、颜色不同。玛瑙的颜色鲜艳，分布均匀，颜色条带很明显，无明显的色源和色根，主要以红色为贵，而翡翠颜色多为片状、丝状等，分布不均匀，在色形中具有色源和色根，主要以绿色为贵。
3、价值不同。一般翡翠的价值要比玛瑙贵很多，好的翡翠玉器价值连城。而玛瑙颜色没有翡翠的鲜艳，闪蓝色较均净，但其透明度也没有翡翠的好，同时对比起来，翡翠的净度要比玛瑙高很多。
