1、成分不同。碘酊又叫做碘酒，它主要是碘和碘化钾的酒精溶液，它能够杀灭多种细菌和真菌，有非常强的消毒效果。而碘伏又叫做聚维酮碘溶液，它主要是以水为溶剂而制成的，也有很好的消毒作用，应用非常的广泛。
2、对皮肤的刺激性不同。碘酊因为含有大量的酒精，所以对皮肤的刺激性非常的强，如果患者的皮肤粘膜有损坏，很容易给患者造成非常大的痛苦。而碘伏的刺激性非常的小，可以直接使用在破损的伤口处，它可以广泛的应用于肌肉注射，静脉注射，手术皮肤消毒。
3、用法不同：碘酒只能用于小面积的皮肤消毒，不能用于黏膜的消毒，而且不能用于大面积的消毒，容易对皮肤引起腐蚀，而碘伏属于中效的杀毒剂，可以用于皮肤及黏膜的消毒。
