刺身的品种主要有金枪鱼、鲷鱼、比目鱼、鲣鱼、多春鱼、鲈鱼以及鲻鱼等。除此之外，也有鲤鱼、鲫鱼等部分淡水鱼。如今制作刺身的材料不再限制在鱼类材料之中，像是螺蛤类（即螺肉、牡蛎肉和鲜贝）、虾类和蟹、海参和海胆，甚至是鸡肉等高蛋白的食物都会被采用。
在古代，鲤鱼则是刺身的上品。还有一些特殊的海产，如章鱼、鱿鱼、墨鱼、鲸鱼也是常见的材料。鲸鱼可以片成较厚的鱼片，但章鱼、鱿鱼和墨鱼却不能片成鱼片，而是利用这些鱼自身的体形切成不算太薄的鱼块，当然也可以算成鱼片。除了鱼片，还有整鱼，一些长不大的微型鱼，如果生吃、活吃的话，也就是一种美味的刺身。鱼肉之外，还有生鱼子，也可以成为刺身。
